MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 308

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015693	GAT	2	6	36	41	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015693	A	7	7	52	58	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015693	ATC	2	6	65	70	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015693	ATC	2	6	99	104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015693	T	7	7	114	120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015693	A	7	7	2714	2720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015693	TGA	2	6	2724	2729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015693	ATT	2	6	2775	2780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015693	TATT	2	8	2843	2850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015693	TAT	2	6	2856	2861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015693	GTTT	2	8	3089	3096	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015693	TGC	2	6	3099	3104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015693	CCGT	2	8	3116	3123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015693	ATC	2	6	3161	3166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015693	TA	4	8	3323	3330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015693	AC	3	6	3345	3350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015693	GCG	2	6	3355	3360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015693	CTT	2	6	3398	3403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015693	T	7	7	3442	3448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015693	TCAAAA	2	12	3475	3486	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015693	T	7	7	3549	3555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015693	AATT	2	8	4540	4547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015693	TTG	3	9	4568	4576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015693	CGG	2	6	4590	4595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015693	ATT	2	6	4637	4642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015693	AAGA	2	8	4679	4686	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015693	TA	3	6	4690	4695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015693	CTAT	2	8	4717	4724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015693	ACTT	2	8	4742	4749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015693	CGA	2	6	4779	4784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015693	TAA	2	6	4817	4822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015693	A	6	6	4892	4897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015693	GGT	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015693	CTT	2	6	4946	4951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015693	ATTC	2	8	4971	4978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015693	GTT	2	6	4998	5003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015693	GCG	2	6	5058	5063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015693	GCT	2	6	5123	5128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015693	TTG	2	6	5146	5151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015693	T	7	7	5156	5162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015693	ATC	2	6	5226	5231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015693	A	7	7	5298	5304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015693	T	6	6	5399	5404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015693	A	6	6	5419	5424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015693	A	6	6	5526	5531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015693	T	6	6	5540	5545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015693	T	8	8	5596	5603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015693	ATG	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015693	ATGAT	2	10	5658	5667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015693	TCAT	2	8	5683	5690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015693	TGT	2	6	5702	5707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015693	CGA	2	6	5709	5714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015693	T	6	6	5749	5754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015693	CTG	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015693	CTT	2	6	5824	5829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015693	T	6	6	5896	5901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015693	ATG	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015693	AACA	2	8	6000	6007	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015693	TG	3	6	6014	6019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015693	TAA	2	6	6083	6088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015693	ATT	2	6	6098	6103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015693	ATT	2	6	6112	6117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015693	A	7	7	8781	8787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015693	G	7	7	8799	8805	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015693	CTT	2	6	8811	8816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015693	TTAT	2	8	8836	8843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015693	T	6	6	8868	8873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015693	T	6	6	10675	10680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015693	TGA	2	6	10706	10711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015693	TGA	2	6	10724	10729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015693	TCT	2	6	11562	11567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015693	T	6	6	13207	13212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015693	GAA	2	6	13220	13225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015693	GAAG	2	8	13233	13240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015693	ATTGGA	2	12	14251	14262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015693	TA	3	6	14277	14282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015693	A	7	7	14318	14324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015693	T	6	6	14358	14363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015693	GCA	2	6	15384	15389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015693	TTTC	2	8	15430	15437	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015693	ATT	2	6	15440	15445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015693	AAG	2	6	16911	16916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015693	CTT	2	6	18081	18086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015693	ATT	2	6	18096	18101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015693	AAG	2	6	19162	19167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015693	TTA	2	6	19230	19235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015693	AAG	2	6	20349	20354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015693	T	6	6	20659	20664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015693	A	6	6	20709	20714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015693	TAT	2	6	20724	20729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015693	A	6	6	20733	20738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015693	TAA	2	6	20744	20749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015693	CAA	2	6	20768	20773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015693	CCAATT	2	12	24783	24794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015693	AAG	2	6	25177	25182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015693	TAG	2	6	25819	25824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015693	A	7	7	28893	28899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015693	T	7	7	31962	31968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015693	AAG	2	6	31977	31982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015693	TCAT	2	8	32397	32404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015693	ATGA	2	8	32423	32430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015693	ATC	2	6	32457	32462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015693	CT	3	6	32502	32507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015693	AGT	2	6	32513	32518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015693	CAA	2	6	32569	32574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015693	TCAAA	2	10	32583	32592	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015693	CAA	2	6	32664	32669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015693	AGG	2	6	32676	32681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015693	CTG	2	6	32698	32703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015693	AGA	2	6	32706	32711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015693	A	7	7	32711	32717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015693	TCA	2	6	32767	32772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015693	ATCAGT	2	12	33923	33934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015693	ACAA	2	8	33950	33957	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015693	GT	3	6	35767	35772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015693	T	6	6	35776	35781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015693	GAT	2	6	35784	35789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015693	GAG	2	6	35794	35799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015693	TAA	2	6	35820	35825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015693	TTC	2	6	35832	35837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015693	A	7	7	35843	35849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015693	ATT	2	6	37404	37409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015693	ACCC	2	8	37416	37423	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_015693	TTAAA	2	10	37468	37477	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015693	A	6	6	37482	37487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015693	T	7	7	38418	38424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015693	TGA	2	6	41348	41353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015693	GAA	2	6	41384	41389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015693	TTG	2	6	41413	41418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015693	CAATG	2	10	41439	41448	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015693	TTA	2	6	41557	41562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015693	A	6	6	41562	41567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015693	TA	3	6	41625	41630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015693	GGTT	2	8	41679	41686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015693	T	6	6	42443	42448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015693	TGA	2	6	42452	42457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015693	TTAT	2	8	42462	42469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015693	GAT	2	6	42476	42481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015693	CTT	2	6	47483	47488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015693	TGT	2	6	54663	54668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015693	GAT	2	6	54685	54690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015693	GGCTT	2	10	54711	54720	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015693	GTT	2	6	57711	57716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015693	TAT	2	6	57735	57740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015693	ATTTT	2	10	57749	57758	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015693	ACAAAT	2	12	57774	57785	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_015693	T	8	8	57806	57813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015693	ATT	2	6	57815	57820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015693	A	6	6	57834	57839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015693	GAA	2	6	57879	57884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_015693	GAA	2	6	95148	95153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_015693	A	6	6	95158	95163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_015693	ACTT	2	8	95172	95179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
300	NC_015693	A	7	7	95201	95207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_015693	A	6	6	95256	95261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_015693	TTG	2	6	95355	95360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
303	NC_015693	A	6	6	95374	95379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_015693	TGG	2	6	96467	96472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
305	NC_015693	GTA	2	6	98789	98794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
306	NC_015693	TAG	2	6	101174	101179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
307	NC_015693	ATTT	2	8	102902	102909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_015693	A	6	6	102932	102937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.